Аминокислоты и генетический код
Земная жизнь основана на четырех буквах генетического кода и 20 аминокислотах. Каждый кодон, кодирующий одну аминокислоту, состоит из трех нуклеотидов. Каждый нуклеотид, в свою очередь, состоит из фосфатного остатка, сахара дезоксирибозы (в случае ДНК) и азотсодержащего основания: аденина (A), тимина (T), гуанина (G) и цитозина (C). В РНК вместо дезоксирибозы находится рибоза, а вместо тимина – урацил (U). Урацил отличается от тимина отсутствием одной метильной группы.
Итак, для кодировки каждой аминокислоты в ДНК (и РНК) используется 3 нуклеотида.
Аланин – GCU или GCC или GCA или GCG
Аргинин – CGU или CGC или CGA или CGG
Аспарагин – AAU или AAC
Аспарагиновая кислота – GAU или GAC
Цистеин – UGU или UGC
Глутаминовая кислота – GAA или GAG
Глутамин – CAA или CAG
Глицин – GGU или GGC или GGA или GGG
Гистидин – GAU или GAC
Изолейцин – AUU или AUC или AUA
Лейцин – CUU или CUC или CUA или CUG
Лизин – AAA или AAG
Метионин – только сочетание AUG, с которого начинается синтез любого белка.
Фенилаланин – UUU или UUC
Пролин – CCU или CCC или CCA или CCG
Серин – UCU или UCC или UCA или UCG
Треонин – ACU или ACC или ACA или ACG
Триптофан – только сочетание UGG
Тирозин – UAU или UAC
Валин – GUU или GUC или GUA или GUG
Сочетание UAA, UAG и UGA означают СТОП – т.е. остановку синтеза полипептидной цепи.
10 Март, 2008 в 12:27
Помнится у грибов какие то свои аминокислоты(а) кодируются?
11 Март, 2008 в 14:59
Правда?
А ссылку можно?
очень интересно
12 Март, 2008 в 21:15
Я думаю стоит покопаться в Википедии.
14 Март, 2008 в 10:49
Большинство живых систем используют стандартный генетический код, однако на сегодня известно, по крайней мере, 16 его вариантов, встречающихся у представителей самых разных ветвей эволюционного древа. Сам принцип кодирования не меняется: аминокислоты кодируются тройками нуклеотидов. Но наряду с организмами, прочитывающими РНК-кодон CUG как лейцин, существуют такие (к их числу относятся многие виды гриба Candida), которые воспринимают его как серин. Другой пример - митохондрии, своего рода крошечные энергетические станции, присутствующие в любой клетке. У них есть собственная ДНК, и в ходе эволюции они сформировали свой генетический код. Например, у митохондрий пекарских дрожжей (Saccharomyces cerevisiae) четыре из шести кодонов, обычно транслирующихся в лейцин, кодируют треонин.
http://www.sciam.ru/2004/7/biotechnology.shtml
14 Март, 2008 в 10:51
Представители почти всех трех доменов живых организмов иногда прочитывают стандартный стоп-кодон UGA как 21-ю аминокислоту селеноцистеин, не относящуюся к 20 стандартным. Селеноцистеин образуется при химической модификации серина на стадии, когда последний еще не отсоединился от тРНК в составе рибосомы. Аналогично у представителей двух доменов (архебактерий и бактерий) стоп-кодон UAG прочитывается как 22-я аминокислота пирролизин.
Там же
14 Март, 2008 в 13:05
Спасибо огромное, Александр!
Выходит, если мы хотим получить организмы с другим набором аминокислот в белках, нам можно не менять сами нуклеотиды, образующие ДНК и РНК, но заменить транспортные РНК, “прочитывающие” данный кодон?
Это сильно облегчает дело!
А то я уже всю голову сломала, пытаясь придумать достойную замену ДНК в клетках европейской жизни
14 Март, 2008 в 13:38
Если думать про замену ДНК на Европе, то надо смотреть другие статьи свежие. А из них проистекает, что короткие цепочки ДНК - жидкие кристаллы, сампроизвольно упорядочивающиеся в слюдяных щелях в водном растворе. То есть ДНК- это как аминокислоты - наиболее энергетически выгодное состояние для сложной самокопирующеся структуры и будет повторятся везде, где есть вода. А вот аминокислоты вполне могут быть более другие. Больше серы например.
А еще отбор пойдет в сторону восстановительных процессов - радиация повышенная. Короткие цепочки чаще будут побеждать.
17 Март, 2008 в 16:31
Ну а РНК? Как Вы думаете, допустимо заменить в “европейских” ДНК тимин урацилом (например)? Или метильная группа в тимине несет какую-то важную (принципиальную) функцию?
Про слюдяные щели не знала, это интересно
18 Март, 2008 в 10:31
http://rnd.cnews.ru/natur_science/news/top/index_science.shtml?2007/11/26/276654
Вот например необычное исследование. ДНК-неизбежность!
Если урацилу найдете комплиментарную пару - будет урацил-чего-нибудь алфавит. А вопрос на нобелевку
18 Март, 2008 в 14:46
Но ведь в составе РНК вместо тимина как раз используется урацил, комплиментарный аденину. Или это специфика именно РНК, а с ДНК такой номер не пройдет?
Не то, чтобы мне так нужен был именно урацил, просто интересно
22 Март, 2008 в 07:01
http://www.sciam.ru/2008/3/biology.shtml
Что бы не выдумывать выдуманное
27 Март, 2008 в 01:36
Спасибо за ссылку
27 Март, 2008 в 17:11
Хорошая статья, спасибо
21 Апрель, 2008 в 10:10
Ав тору огромное спасибо за подборку!!! есть мног чего интересного!!!
И отдельное спасибо Александру за ссылочку… Очень пришлась кстати!!!))